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通过单细胞测序了解CAR-T细胞治疗的应答机制:见解和挑战

2024-04-19 48

嵌合抗原受体(CAR) T细胞疗法在治疗B细胞恶性肿瘤方面取得了惊人的进展,包括白血病、淋巴瘤和多发性骨髓瘤虽然许多患者获得了持久的长期缓解,但很大一部分患者要么没有应答,要么最终复发,这促使人们更好地了解失败和/或耐药机制。CD19和BCMA CAR的肿瘤抗原丢失解释了少数复发,相比之下,CAR-T细胞本身的表型作为应答的关键决定因素受到关注,这些研究利用了单细胞分析技术,如流式细胞术、飞行时间细胞术(CyTOF)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)。

    往期推送:

单细胞技术如何用于优化CAR-T开发和患者个体化治疗

目前,使用单细胞测序的研究已用于使用4-1BB和基于CD28z的自体CAR-T细胞产品治疗的淋巴瘤,以及用于白血病和多发性骨髓瘤的CAR-T细胞产品。单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)能够检测数千个细胞的整个转录组,揭示新的细胞程序。它可以准确确认表达CAR转录本的细胞,并结合其他技术如TCR序列分析来监测T细胞克隆性,以及通过索引蛋白检测对转录组和表位进行细胞索引。然而,作为一项相对较新的技术,对单细胞数据的统计分析和解释的最佳实践的共识仍在发展中。

2024年3月,《Blood Cancer Discov》期刊发布了题为“Understanding Mechanisms of Response to CAR T-cell Therapy through Single-Cell Sequencing: Insights and Challenges”的文章,通过单细胞测序技术,研究人员发现CAR-T细胞治疗后,不同细胞亚群的表达模式和功能状态存在差异。这些洞察为理解CAR-T细胞治疗的效果差异提供了线索。


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